2ème tour (dimanche 28 août 2016)
Match 1 : (match 2) Charny (D2) ou Saint-Georges (D1) - Cerisiers (PL)
Match 2 : Sens Racing Club (PD) – (match 1) Migennes (PL) ou Gatinais (PL)
Match 3 : Charmoy (PD) - Chassignelles Ancy (D1)
Match 4 : Saint-Serotin (D2) - Chablis (PD)
Match 5 : Sens Franco-Portugais (PD) - Varennes (PL)
Match 6 : Joigny (PL) - Chatillon Colombine (PD)
Match 7 : Villeneuve sur Yonne (D3) - Gron (PD)
Match 8 : Véron (D1) - Gurgy (D2)
Match 9 : Cosnois (D3) - Vauzelles (PL)
Match 10 : Magny (PD) – (match 4) Lucenay Cossaye (D1) ou Saint-Benin (PL)
Match 11 : Dornes Neuville (PL) - Corbigny (PD)
Match 12 : Garchizy (PH) - Fourchambault (PL)
Match 13 : Montillot Chand (D2) – Clamecy (PH)
Match 14 : (match 3) Chevannes (D1) ou Saint-Fargeau (D1) - Bourbon-Lancy (PL)
Match 15 : Marzy (PD) - Luthenay (D1)
Match 16 : Cosne (PH) – La Charité (PH)
Match 17 : (match 6) Buxy (D1) ou Palinges (PL) – Paray (PH)
Match 18 : Perrecy (PD) - Digoin (PL)
Match 19 : Pouilloux (D1) - Saint-Martin Senozan (D1)
Match 20 : Mâcon Sporting Club (PE) - Blanzy (PL)
Match 21 : Grury Issy (D2) - La Clayette (PD)
Match 22 : Saint-Vallier (D2) - Bois du Verne (PD)
Match 23 : (match 7) Cluny (PL) ou La Roche Vineuse (PD) - Crèches (PH)
Match 24 : (match 5) Saint-Bonnet La Guiche (PL) ou Sud Foot 71 (PL) - Clessé (D2)
Match 25 : Rigny sur Arroux (PD) – La Chapelle de Guinchay (PH)
Match 26 : Saillenard (D2) – Sornay (PL)
Match 27 : Epervans (PD) – Saint-Marcel (PH)
Match 28 : Varennes Saint-Sauveur (D2) - (match
Tournus (D1) ou Hurigny (PL)
Match 29 : Châteaurenaud (D1) - Mervans (PD)
Match 30 : Sennecey le Grand (PD) - Sassenay Virey (PD)
Match 31 : (match 9) Crissey (PD) ou Châtenoy le Royal (PL) - Saint-Martin en Bresse (D2)
Match 32 : Cuiseaux Champagnat (D1) - Bresse Nord (D1)
Match 33 : Cuisery (D2) - Abergement de Cuisery (PL)
Match 34 : Le Creusot (PL) - (match 10) Saulon Corcelles (D1) ou Beaune (PH)
Match 35 : Gergy (PE) – Auxonne (PH)
Match 36 : Torcy UFC (D1) - Chassagne Montrachet (PD)
Match 37 : Etang sur Arroux (D1) - Genlis (PL)
Match 38 : Aiserey Izeure (PD) - Rully (PD)
Match 39 : Lacanche (D2) - Le Breuil (PL)
Match 40 : Bligny sur Ouche (D2) - (match 11) Igornay (D1) ou Meursault (PH)
Match 41 : Brazey en Plaine (D1) - Chalon ACF (PL)
Match 42 : Talant (D1) - Daix (PD)
Match 43 : Ouche (D2) – Dijon USC (PH)
Match 44 : (match 12) Marsannay (PL) ou Chevigny Saint-Sauveur (PH) – Mirebeau-Pontailler-Lamarche (PL)
Match 45 : Remilly (D1) - Vitteaux (D2)
Match 46 : Plombières (PL) – Dijon ASPTT (PH)
Match 47 : (match 13) Dijon ULFE (PL) ou Val de Norge (PL) - Chenove (D1)
Match 48 : Longvic (PH) - Montbard-Venarey (PL)
Match 49 : Fontaine les Dijon (PH) – Is sur Tille (PH)